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Japanese English --> CBBD-OILについて フォーラムについて メンバー紹介 研究テーマと計画 論文 連絡先 --> --> Japanese English --> CBBD-OILについて フォーラムについて メンバー紹介 研究テーマと計画 論文 連絡先 早大が有する日本有数の生体システムビッグデータや技術アドバンテージに対し、産総研・早大双方の情報解析シーズやデータ解析技術を合わせて生命現象のメカニズムの理解を目指します。 細胞や生物をシステムとして理解することで、 疾病メカニズムの解明 海洋や微生物による医薬品原料の探索・生産 究極の個別化医療への貢献 を目指した研究開発を行います。 さらに、産学官ネットワークの構築により、民間企業の参画による「橋渡し」につながる目的基礎研究の強化や、世界標準となる最先端の生命情報解析技術の研究開発を行います。 さらに詳しく ニュース 年/月/日 ニュースの内容 [HERE] --> 2024/04/23 CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが共著者となっている論文『Individual Atg8 paralogs and a bacterial metabolite sequentially promote hierarchical CASM-xenophagy induction and transition』が『Cell Reports』 にオンライン掲載されました。 [HERE] 2024/04/23 シングルセルデータ解析班・玉野孝一さんが筆頭著者となっている論文『Double knockout of two target genes via genome co-editing using a nitrate transporter gene nrtA and a putative thiamine transporter gene thiI as selectable markers in Aspergillus oryzae』が『Journal of Bioscience and Bioengineering』 にオンライン掲載されました。 [HERE] 2024/04/15 元生体分子情報解析班RAの若林佑太郎さんが筆頭著者、同班・曽超さん、同班長・浜田道昭さんが共著者となっている論文『Identification of a novel noncoding RNA transcript TISPL upregulated by stressors that stimulate ATF4』が『Gene』 に掲載されました。 [HERE]   2024/04/04 元シングルセルデータ解析班RAの木伏真子さんが筆頭著者、同班の西川洋平さん、細川正人さん、元RAの井手圭吾さんが共著者、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが責任著者となっている論文『Analysis of microbial dynamics in the soybean root-associated environments from community to single-cell levels』が『Journal of Bioscience and Bioengineering』 に掲載されました。 [HERE] 2024/03/25 日本農芸化学会2024年度大会（創立100周年記念大会）の附設展示会「バイオビジネスアピールエリア」（3/25-27＠東京農業大学世田谷キャンパス桜丘アリーナ）に早大OILとして出展します。 [詳細案内] 2024/03/21 CBBD-OIL副ラボ長・鴫 直樹さんが執筆した解説『技術で未来拓く 産総研の挑戦 (303) ～たんぱく質の合成、硫黄修飾が重要な役割～』が日刊工業新聞に掲載されました。 [HERE] 2024/03/08 元生体分子情報解析班RAの 道下瑛陽、同班長の浜田道昭さんが共著者となっている論文『RaptGen-Assisted generation of an RNA/DNA hybrid aptamer against SARS-CoV-2 spike protein』が『Biochemistry』 に掲載されました。 [HERE]   2024/03/07 シングルセルデータ解析班の宮崎亮さんが責任著者となっている論文『Gustatory responsiveness of honey bees colonized with a defined or conventional gut microbiota』が『Microbes and Environments』 に掲載されました。 [HERE]   2024/03/13 第4回ファーマラボEXPO大阪（3/13-15＠インテックス大阪 ）に早大OILとして出展します。アカデミックフォーラムにて鴫副ラボ長が発表を行います（3/13）。 招待券を [ここ]から登録・ダウンロードしてカラー印刷・持参頂くか、メールのQRコードを提示してご入場ください。 [詳細案内] [発表プログラム] 2024/01/19 『実験医学増刊 Vol.42 No.2　あなたのラボから薬を生み出す　アカデミア創薬の実践』（羊土社）の第１章「4. シングルセル/微小組織マルチオミクス解析』を、生体分子情報解析班の由良敬さん、松永浩子さん、同班長の浜田道昭さん、シングルセルデータ解析班の細川正人さん、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんらが執筆しました。 [HERE] 2024/01/18 生体分子情報解析班班長の浜田道昭さんが責任著者となっている論文『Deep generative design of RNA family sequences』が『Nature Methods』 に掲載されました。 [HERE] プレスリリース「機能性RNAの配列設計を支援する深層生成モデル“RfamGen”の開発」が早稲田大学のホームページに掲載されました。 [HERE] 2024/01/03 シングルセルデータ解析班RAの實野佳奈さんが筆頭著者、同班の西川洋平さん、峯田克彦さんが共著者、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが責任著者となっている論文『Comparative single-cell genomics of Atribacterota JS1 in the Japan Trench hadal sedimentary biosphere』 が『mSphere』に掲載されました。 [HERE]   2023/12/21 シングルセルデータ解析班RAの我妻竜太さんが、第46回日本分子生物学会年会で「MBSJ2023サイエンスピッチ優秀発表賞 / MBSJ2023 Best Science Pitch Award」を受賞しました。 [HERE] 2023/12/19 生体分子情報解析班の本野千恵さんが共著者となっている論文『Atg15 is a vacuolar phospholipase that disintegrates organelle membranes』が『Cell Reports』 に掲載されました。 [HERE] プレスリリース「細胞小器官の膜を溶解する酵素の活性化機構を解明」が産総研ホームページに掲載されました。 [HERE] 2023/12/12 CBBD-OIL副ラボ長・鴫 直樹さんが執筆した総説『高度好熱菌由来 tRNA硫黄転移酵素の作用メカニズム』が『極限環境微生物の先端科学と社会実装最前線』( 株式会社エヌ・ティー・エスから刊行) に掲載されます。極限環境生物分野の専門家66名による、約10年ぶりの大型専門書です。こちら[HERE]から電子試読（無料）も可能です。 2023/12/12 生体分子情報解析班・Martin C. Frithさんが筆頭著者となっている論文『DNA conserved in diverse animals since the Precambrian controls genes for embryonic development』 が『Molecular Biology and Evolution』に掲載されました。 [HERE] 2023/11/24 生体分子情報解析班・Martin C. Frithさんが共著者となっている論文『Cost-effective Cas9-mediated targeted sequencing of Spinocerebellar ataxia repeat expansions』が『Journal of Molecular Diagnostics』 に掲載されました。 [HERE] 2023/11/23 元シングルセルデータ解析班・山﨑美輝さん、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが共著者となっている論文『Identification of target cells of human papillomavirus 18 using squamocolumnar junction organoids』が『Cancer Science』 に掲載されました。 [HERE] 2023/11/11 シングルセルデータ解析班・峯田克彦さんが責任著者、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが共著者となっている論文『Glutamate-sensing genes are conserved among populations compared to glutamate metabolism genes』が『Annals of Nutrition and Metabolism』 に掲載されました。 [HERE] 2023/10/26 元生体分子情報解析班RAの細田至温さんが筆頭著者、同班長の浜田道昭さんが責任著者となっている論文『Probiotic responder identification in cross-over trials for constipation using a Bayesian statistical model considering lags between intake and effect periods』が『Computational and Structural Biotechnology Journal』 に掲載されました。 [HERE] 2023/10/10 元生体分子情報解析班RAの原快成さんが筆頭著者、同班長の浜田道昭さんが責任著者となっている論文『DeepRaccess: high-speed RNA accessibility prediction using deep learning』が『Frontiers in Bioinformatics』 に掲載されました。 [HERE] 2023/10/09 生体分子情報解析班RAの小菅将斗さんが、「生命情報科学若手の会 第15回研究会」でPacBio / トミーデジタルバイオロジー賞（Best Activator Award）ならびにBIOTA賞（Best NGS Award）を受賞しました。 [HERE] 2023/10/06 シングルセルデータ解析班RAの實野佳奈さんが、オーストラリアで行われた「APMBC（Asia Pasific Marine Biotechnology Conference）2023」で Best session presentation awardを受賞しました。 [HERE] 2023/09/27 シングルセルデータ解析班の古藤日子さんが筆頭・責任著者、元CBBD-OIL PDのPui Shan Wonさん、前CBBD-OIL副ラボ長・油谷幸代さんが共著者となっている論文『Social isolation shortens lifespan through oxidative stress in ants』が『Nature communications』 に掲載されました。 [HERE] プレスリリース「アリはなぜ１匹で生きられないのか？」が産総研ホームページに掲載されました。 [HERE] 2023/09/12 シングルセルデータ解析班・細川正人さんが責任著者の論文『Uncultured prokaryotic genomes in the spotlight: An examination of publicly available data from metagenomics and single-cell genomics』が『Computational and Structural Biotechnology Journal』 に掲載されました。 [HERE] 2023/09/09 生体分子情報解析班RAの小菅将斗さんが筆頭発表者となっているポスター、および、元生体分子情報解析班RAの細田至温さん、同班班長の浜田道昭さんが共同発表者となっているポスター（筆頭発表者：早稲田大学・柳本香菜美さん）計２件が2023年日本バイオインフォマティクス学会年会・第12回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2023）で優秀ポスター賞を受賞しました。 [HERE] 2023/09/08 シングルセルデータ解析班・細川正人さんが筆頭・責任著者、同班・西川洋平さんが共著者の論文『Tools for microbial single-cell genomics for obtaining uncultured microbial genomes』が『 Biophysical Reviews 』 に掲載されました。 [HERE] 2023/09/05 シングルセルデータ解析班RAの諏訪駿之助さんが、「第75回日本生物工学会大会」で 学生優秀発表賞を受賞しました。 [HERE] 2023/08/24 シングルセルデータ解析班の宮崎亮さんが共著者となっている論文『The architecture of metabolic networks constrains the evolution of microbial resource hierarchies』が『Molecular Biology and Evolution』 に掲載されました。 [HERE] 2023/08/09 CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが共著者となっている論文『Structural basis for cross-group recognition of an influenza virus hemagglutinin antibody that targets postfusion stabilized epitope』が『PLoS Pathogens』 に掲載されました。 [HERE] 2023/08/08 生体分子情報解析班班長・浜田道昭さんが共著者となっている論文『Neat1 lncRNA organizes the inflammatory gene expressions in the dorsal root ganglion in neuropathic pain caused by nerve injury』が『Frontiers in Immunology』 に掲載されました。 [HERE] 2023/07/19 生体分子情報解析班・曽超さんが筆頭著者、同班長の浜田道昭さんが責任著者となっている論文『Landscape of semi-extractable RNAs across five human cell lines』が『Nucleic Acids Research』 に掲載されました。 [HERE] プレスリリース「5種類のヒト培養細胞から新たな1,074種類の難溶性RNAを同定」が早稲田大学ホームページに掲載されました。 [HERE] The American Association for the Advancement of Science (AAAS)の“EurekAlert!” でも紹介されています。 [HERE] 2023/07/05 第5回ファーマラボEXPO東京（7/5-7＠東京ビッグサイト ）に早大OILとして出展します。アカデミックフォーラムにて安佛副ラボ長が発表を行います（7/6）。 招待券を [ここ]からダウンロードして印刷・持参頂くか、URLをコピーしてスマートフォンに画面表示してご入場ください。（名刺1枚必要です） [詳細案内] [発表プログラム] 2023/06/19 産総研生命工学領域の広報誌「ざ♡らいふ」6月号に当OILの紹介記事が掲載されました。 [HERE] 2023/06/14 シングルセルデータ解析班RAの平木優到さんが、第21回産総研・産技連LS-BT合同研究発表会でポスター賞を受賞しました。 [HERE] 2023/06/13 第21回 産総研・産技連LS-BT合同研究発表会が6/13,14の２日間開催されます。 [HERE]6/14のポスターセッションにおいて、鴫副ラボ長およびRA8名が発表を行います。 2023/06/11 CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが共著者、シングルセルデータ解析班・細川正人さんが責任著者となっている論文『Enhancing the sensitivity of bacterial single-cell RNA sequencing using RamDA-seq and Cas9-based rRNA depletion』が『Journal of Bioscience and Bioengineering』に掲載されました。 [HERE]   2023/06/10 元生体分子情報解析班・RAの関根光太郎さん、生体分子情報解析班・小野口真広さん、同班長の浜田道昭さんの論文『Transposons contribute to the acquisition of cell type-specific cis-elements in the brain』が『Communications Biology』に掲載されました。 [HERE] プレスリリース「“動くDNA”が哺乳類の脳の進化過程で機能や形態の獲得に貢献するメカニズムを解明」が早稲田大学ホームページに掲載されました。 [HERE] 2023/06/07 生体分子情報解析班・Martin C. Frithさんが共著者となっている論文『Biallelic structural variations within FGF12 detected by long-read sequencing in epilepsy』が『Life Science Alliance』 に掲載されました。 [HERE] 2023/06/03 生体分子情報解析班・齋藤裕さんが責任著者となっている論文『タンパク質の言語モデル』が『JSBi Bioinformatics Review』 に掲載されました。 [HERE] 2023/05/31 元シングルセルデータ解析班RAの木伏真子さんが、生物工学学生優秀賞（飛翔賞） を受賞しました。 [HERE] 2023/05/27 元シングルセルデータ解析班RAの久保昂也さん、堀井俊平さんが共著者、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが責任著者となっている論文『Single-cell level Raman molecular profiling reveals the classification of growth phases of Chaetoceros tenuissimus』が『Journal of Physical Chemistry B』に掲載されました。 [HERE] 2023/05/25 生体分子情報解析班班長・浜田道昭さんが共著者となっている論文『Recent trends in RNA informatics: a review of machine learning and deep learning for RNA secondary structure prediction and RNA drug discovery 』が『Briefings in Bioinformatics』に掲載されました。 [HERE] 2023/05/20 CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが共著者となっている論文『White spot syndrome virus (WSSV) modulates lipid metabolism in white shrimp』が『Communications Biology』に掲載されました。 [HERE]     2023/05/13 シングルセルデータ解析班・細川正人さんが筆頭・責任著者、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが共著者となっている論文『Target enrichment of uncultured human oral bacteria with phage-derived molecules found by single-cell genomics』が『Journal of Bioscience and Bioengineering』に掲載されました。 [HERE]   2023/05/11 生体分子情報解析班班長・浜田道昭さん、同RAの武田 淳志さんが共著者となっている論文『Mobile element variation contributes to population-specific genome diversification, gene regulation and disease risk』が『Nature Genetics』に掲載されました。 [HERE] プレスリリース「転移因子多型の疾患リスクを解明 －見過ごされてきたゲノム多型に着目し、ゲノム医療に貢献－」が理化学研究所ホームページに掲載されました。 [HERE]   2023/05/11 CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが共著者となっている論文『Alzheimer's disease heterogeneity explained by polygenic risk scores derived from brain transcriptomic profiles』が『Alzheimers & Dementia』に掲載されました。 [HERE] 2023/05/10 CBBD-OIL副ラボ長・安佛尚志さん、シングルセルデータ解析班・西川洋平さんが共同筆頭著者、シングルセルデータ解析班・細川正人さんが共著者、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが共同責任著者となっている論文『Combined actions of bacteriophage-encoded genes in Wolbachia-induced male lethality』が『iScience』に掲載されました。 [HERE] プレスリリース「オス殺し細菌の進化を支えたバクテリオファージの発見」が東京農工大学ホームページに掲載されました。 [HERE] 2023/05/08 シングルセルデータ解析班の宮崎亮さんが責任著者、古藤日子さんが共著者となっている論文『Basic structures of gut bacterial communities in eusocial insects』が『Insects』に掲載されました。 [HERE] 2023/04/21 シングルセルデータ解析班・玉野孝一さんが筆頭・責任著者となっている論文『Editorial: The use of metabolic engineering techniques to increase the productivity of primary and secondary metabolites within filamentous fungi』が『Frontiers in Fungal Biology』に掲載されました。 [HERE] 2023/04/21 生体分子情報解析班・齋藤裕さんが共著者となっている論文『A multiomics atlas of brown adipose tissue development over time』が『Endocrinology』に掲載されました。 [HERE] 2023/04/06 シングルセルデータ解析班・宮崎亮さんが共著者となっている論文『Inference of transcriptome signatures of Escherichia coli in long-term stationary phase』が『Scientific Reports』に掲載されました。 [HERE] 2023/04/01 シングルセルデータ解析班・玉野孝一さんが筆頭・責任著者となっている論文『Overexpression of a predicted transketolase gene and disruption of an α-1,3-glucan synthase gene in Aspergillus oryzae DGLA3 strain enhances the yield of free dihomo-γ-linolenic acid』が『Bioscience, Biotechnology & Biochemistry』に掲載されました。 [HERE] 2023/04/01 2023年4月1日付で、副ラボ長に鴫 直樹さんが就任しました。 2023/03/08 第3回ファーマラボEXPO大阪（3/08-10＠インテックス大阪 ）に早大OILとして出展します。アカデミックフォーラムにて安佛副ラボ長が発表を行います（3/09）。 招待券を [ここ]からダウンロードして印刷・持参頂くか、URLをコピーしてスマートフォンに画面表示してご入場ください。（名刺1枚必要です） [詳細案内] [発表プログラム] 2023/02/03 生体分子情報解析班・齋藤裕さんが共著者となっている論文『Engineering the substrate specificity of toluene degrading enzyme XylM using biosensor XylS and machine learning』が『ACS Synthetic Biology』に掲載されました。 [HERE] 2023/02/02 生体分子情報解析班・Martin C. Frithさんが責任著者となっている論文『An immune-suppressing protein in human endogenous retroviruses』が『Bioinformatics Advances』に掲載されました。 [HERE] 2023/01/25 生体分子情報解析班・Martin C. Frithさんが筆頭著者となっている論文『How to optimally sample a sequence for rapid analysis』が『Bioinformatics』に掲載されました。 [HERE] 2023/01/22 生体分子情報解析班・齋藤裕さんが共著者となっている論文『Selection of target-binding proteins from the information of weakly enriched phage display libraries by deep sequencing and machine learning』が『mAbs』に掲載されました。 [HERE] 2023/01/05 生体分子情報解析班・本野千恵さんが共著者となっている論文『A multipoint guidance mechanism for β-barrel folding on the SAM complex』が『Nature Structural & Molecular Biology』に掲載されました。 [HERE] 2022/12/22 シングルセルデータ解析班・玉野孝一さんが責任著者となっている論文『How to improve the production of peptidyl compounds in filamentous fungi』が『Frontiers in Fungal Biology』に掲載されました。 [HERE] 2022/12/12 元シングルセルデータ解析班・井手圭吾さん、シングルセルデータ解析班・西川洋平さん、元シングルセルデータ解析班RA・塚田祐子さん、元生命機能解析班・小川雅人さん、シングルセルデータ解析班RA・我妻竜太さん、シングルセルデータ解析班・細川正人さん、生体分子情報解析班・由良敬さん、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんらの論文『Targeted single-cell genomics reveals novel host adaptation strategies of the symbiotic bacteria Endozoicomonas in Acropora tenuis coral』が『Microbiome』 に掲載されました。 [HERE] 2022/12/05 生体分子情報解析班・齋藤裕さんが共著者となっている論文『EvoOpt: an MSA-guided, fully unsupervised sequence optimization pipeline for protein design』がMachine Learning in Structural Biology（MLSB)　のワークショップにて発表されました。 [HERE] 2022/11/25 生体分子情報解析班・齋藤裕さんの論文『深層学習によるタンパク質の機能予測と設計』が『生物工学会誌』に掲載されました。 [HERE] 2022/11/20 シングルセルデータ解析班RAの我妻竜太さん、シングルセルデータ解析班・山﨑美輝さん、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんらが共著者となっている論文『Cells with stem-like properties are associated with the development of HPV18-positive cervical cancer』が『Cancer Science』に掲載されました。 [HERE] 2022/11/18 シングルセルデータ解析班・安武義晃さんが共著者となっている論文『Disruption of SMC-related genes promotes recombinant cholesterol esterase production in Burkholderia stabilis』が『Applied Microbiology and Biotechnology』 に掲載されました。 [HERE] 22022/11/14 シングルセルデータ解析班・山﨑美輝さん、シングルセルデータ解析班RAの我妻竜太さん、元シングルセルデータ解析班・井手圭吾さん、シングルセルデータ解析班・細川正人さんらが共著者、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが責任著者となっている論文『Reproducible and sensitive micro-tissue RNA sequencing from formalin-fixed paraffin-embedded tissues for spatial gene expression analysis』が『Scientific　Report』に掲載されました。 [HERE] 2022/10/28 シングルセルデータ解析班・安武義晃さんが共著者となっている論文『Structural basis for the substrate specificity switching of lysoplasmalogen-specific phospholipase D from Thermocrispum sp. RD004668』が『Bioscience Biotechnology and Biochemistry』 に掲載されました。 [HERE] 2022/10/19 元配列解析アルゴリズム班RA・片山研太さん、生体分子情報解析班RA・久保顕登さん、元生命機能解析班RA・露崎隼さん、生体分子情報解析班班長・浜田道昭さんらの論文『Structure-based screening for functional non-coding RNAs in fission yeast identifies a factor repressing untimely initiation of sexual differentiation』が『Nucleic Acids Research』に掲載されました。 [HERE] プレスリリース「細胞の性分化を阻止する長鎖ノンコーディングRNAを発見」が早稲田大学ホームページに掲載されました。 [HERE] 2022/10/03 元シングルセルデータ解析班・井手圭吾さん、シングルセルデータ解析班・西川洋平さん、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんらの論文『The Effect of Co-Culture of Two Coral Species on Their Bacterial Composition Under Captive Environments』が『Marine Biotechnology』に掲載されました。 [HERE] 2022/09/29 シングルセルデータ解析班・西川洋平さん、細川正人さん、RAの我妻竜太さん、元シングルセルデータ解析班・井手圭吾さん、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんらの論文『Validation of the application of gel beads-based single-cell genome sequencing platform to soil and seawater』が『ISME Communications』に掲載されました。 [HERE] 2022/09/06 元生命機能解析班・西嶋傑さんらの論文『Extensive gut virome variation and its associations with host and environmental factors in a population-level cohort』が『Nature Communications』に掲載されました。 [HERE] プレスリリース「腸内に生息するバクテリオファージの全貌解明」が早稲田大学ホームページに掲載されました。 [HERE] 2022/08/22 元DRデータ解析班班長・福井一彦さん、生体分子情報解析班・本野千恵さんらの論文『Phosprof: pathway analysis database of drug response based on phosphorylation activity measurements』が『Database』に掲載されました。 [HERE] 2022/08/22 シングルセルデータ解析班RAの我妻竜太さんが、スイスで行われた「18th International Symposium on Microbial Ecology」で Student Poster Award を受賞しました。 [HERE] 2022/08/05 元シングルセルデータ解析班・井手圭吾さん、CBBD-OILラボ長・竹山春子さん、シングルセルデータ解析班・細川正人さんらの論文『Exploring strain diversity of dominant human skin bacterial species using single-cell genome sequencing』が『Frontiers in Microbiology』に掲載されました。 [HERE] 2022/07/13 第４回ファーマラボEXPO東京（7/13-15＠東京ビッグサイト）に早大OILとして出展します。アカデミックフォーラムにて安佛副ラボ長が発表を行います（7/14）。 [HERE] 2022/07/11 生体分子情報解析班・本野千恵さんが共著者となっている論文『Imputation-free reconstructions of three-dimensional chromosome architectures in human diploid single-cells using allele-specified contacts』が『Scientific Reports』に掲載されました。 [HERE] 2022/07/08 元配列解析アルゴリズム班・曽超さん、同班長・浜田道昭さんらの論文『Bioinformatics approaches for determining the functional impact of repetitive elements on non-coding RNAs』が『Methods in Molecular Biology』に掲載されました。 [HERE] 2022/07/01 元生命機能解析班・西嶋傑さんらの論文『Population-level metagenomics uncovers distinct effects of multiple medications on the human gut microbiome』が『Gastroenterology』に掲載されました。 [HERE] プレスリリース「ヒト腸内細菌への全貌を解明」が早稲田大学ホームページに掲載されました。 [HERE] 2022/06/29 シングルセルデータ解析班RAの我妻竜太さんが第20回産総研・産技連LS-BT合同研究発表会でポスター賞を受賞しました。 [HERE] 2022/06/03 生体分子情報解析班（旧配列解析アルゴリズム班）班長・浜田道昭さんが携わった研究活動のプレスリリース「人工知能技術を応用した基盤情報技術RaptGenを開発」が早稲田大学ホームページに掲載されました。 [HERE] 2022/06/03 「メンバー紹介」を更新しました。 2022/05/18 生体分子情報解析班・齋藤裕さんが共著者となっている論文『AI and computational chemistry-accelerated development of an alotaketal analogue with conventional PKC selectivity』が『Chemical Communications』に掲載されました。 [HERE] 2022/04/13 シングルセルデータ解析班・玉野孝一さんの論文『Concomitant knockout of target and transporter genes in filamentous fungi by genome co-editing』が『MicrobiologyOpen』に掲載されました。 [HERE] 2022/04/08 元生命機能解析班・西嶋傑さんが共著者となっている論文『Metagenomic identification of microbial signatures predicting pancreatic cancer from a multinational study』が『Gastroenterology』に掲載されました。 [HERE] 2022/04/04 シングルセルデータ解析班・安武義晃さんが共著者となっている論文『Scaffold size-dependent effect on the enhanced uptake of antibiotics and other compounds by Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa』が『Scientific Reports』に掲載されました。 [HERE] 2022/04/01 メンバーの異動・退職に伴う体制変更があり、副ラボ長に安佛尚志さんが就任しました。 ※ホームページの内容も順次更新していきますので、しばらくお待ちください。 2022/03/28 生体分子情報解析班・Martin C. Frithさんの論文『Paleozoic protein fossils illuminate the evolution of vertebrate genomes and transposable elements』が『Molecular Biology and Evolution』に掲載されました。 [HERE] 2022/03/02 元生命機能解析班・小川雅人さん（筆頭著者）、シングルセルデータ解析班・井手圭吾さん、CBBD-OIL参画者・西川洋平さん、CBBD-OILラボ長・竹山春子さん（責任著者）らの論文『Single-cell metabolite detection and genomics reveals uncultivated talented producer』が『PNAS Nexus』に掲載されました。 [HERE] 2022/02/24 シングルセルデータ解析班班長・安佛尚志さんらの研究成果『カミキリムシに不妊化現象を引き起こす細菌を発見 ―今後の害虫防除資材としての開発に期待―』が森林総合研究所からプレスリリースされました。 [HERE] 2022/01/14 シングルセルデータ解析班班長・安佛尚志さんが共著者となっている論文『Cytoplasmic incompatibility in the semivoltine longicorn beetle Acalolepta fraudatrix (Coleoptera: Cerambycidae) double infected with Wolbachia』が『PLoS ONE』に掲載されました。 [HERE] --> 2021/12/13 シングルセルデータ解析班RAの我妻竜太さんがウイルス学若手研究集会2021で優秀発表賞を受賞しました。 [HERE] 2021/12/10 生命機能解析班・玉野孝一さんが筆頭著者となっている論文『Major involvement of two laccase genes in conidial pigment biosynthesis in Aspergillus oryzae』が『Applied Microbiology and Biotechnology』に掲載されました。 [HERE] 2021/12/07 生体分子情報解析班（旧配列解析アルゴリズム班）班長・浜田道昭さんが2021年度早稲田大学リサーチアワード（国際研究発信力）を受賞しました。 [HERE] 2021/12/02 シングルセルデータ解析班RAの我妻竜太さんが第11回CSJ化学フェスタ2021で優秀ポスター発表賞を受賞しました。 [HERE] 2021/12/01 生命機能解析班・玉野孝一さんが筆頭著者となっている論文『Metabolic engineering techniques to increase the productivity of primary and secondary metabolites within filamentous fungi』が『Frontiers in Fungal Biology』に掲載されました。 [HERE] 2021/11/19 配列解析アルゴリズム班・齋藤裕さんが筆頭著者となっている論文『Machine-learning-guided library design cycle for directed evolution of enzymes: The effects of training data composition on sequence space exploration』が『ACS Catalysis』に掲載されました。 [HERE] 2021/10/12 生命機能解析班・井手圭吾さん、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが共著者となっている論文『Recovery of strain-resolved genomes from human microbiome through an integration framework of single-cell genomics and metagenomics』が『Microbiome』に掲載されました。 [HERE] 2021/10/08 元配列解析アルゴリズム班・曽超さん、同班長・浜田道昭さんが共著者となっている論文『Impact of human gene annotations on RNA-seq differential expression analysis』が『BMC Genomics』に掲載されました。 [HERE] 2021/09/29 元生命機能解析班・木口悠也さんが筆頭著者、元生命機能解析班・西嶋傑さんが共著者となっている論文『Long-read metagenomics of multiple displacement amplified DNA of low-biomass human gut phageomes by SACRA pre-processing chimeric reads』が『DNA Research』に掲載されました。 [HERE] 2021/09/23 生命機能解析班・井手圭吾さん、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが共著者となっている論文『Comparative analysis of mitochondrial genomes in Gryllidea (Insecta: Orthoptera): Implications for adaptive evolution in ant-loving crickets』が『Genome Biology and Evolution』に掲載されました。 [HERE] 2021/07/21 配列解析アルゴリズム班・齋藤裕さんが共著者となっている論文『Machine learning approach for discrimination of genotypes based on bright-field cellular images』が『npj Systems Biology and Applications』に掲載されました。 [HERE] 2021/07/15 配列解析アルゴリズム班RA・細田至温さん、同班長・浜田道昭さんらの研究成果『時間経過に伴う細菌相互作用の変化を推定する手法を開発』が早稲田大学WEBサイトで紹介されました。 [HERE] 2021/07/02 元配列解析アルゴリズム班・小野口真広さん、曽超さん、同班長・浜田道昭さんらの論文『Binding patterns of RNA-binding proteins to repeat-derived RNA sequences reveal putative functional RNA elements』が『NAR Genomics and Bioinformatics』に掲載されました。 [HERE] 2021/06/26 配列解析アルゴリズム班・齋藤裕さんが責任著者となっている論文『Evotuning protocols for Transformer-based variant effect prediction on multi-domain proteins』が『Briefings in Bioinformatics』に掲載されました。 [HERE] 2021/06/02 生命機能解析班・安武義晃さんが共著者となっている論文『Biochemical and structural properties of entecavir-resistant hepatitis B virus polymerase with L180M/M204V mutations』が『Journal of Virology』に掲載されました。 [HERE] 2021/05/28 配列解析アルゴリズム班・齋藤裕さんが共著者となっている論文『Comparative analysis of the relationship between translation efficiency and sequence features of endogenous proteins in multiple organisms』が『Genomics』に掲載されました。 [HERE] 2021/05/23 元配列解析アルゴリズム班・井内仁志さん、配列解析アルゴリズム班・松谷太郎さん、細田至温さん、同班長・浜田道昭さんが共著者となっている論文『Representation learning applications in biological sequence analysis』が『Computational and Structural Biotechnology Journal』に掲載されました。 [HERE] 2021/04/13 元配列解析アルゴリズム班・曽超さん、同班長・浜田道昭さんが共著者となっている論文『Long non-coding RNA CRNDE is involved in resistance to EGFR tyrosine kinase inhibitor in EGFR-mutant lung cancer via eIF4A3/MUC1/EGFR signaling』が『International Journal of Molecular Sciences』に掲載されました。 [HERE] 2021/04/12 配列解析アルゴリズム班・細田至温さん、同班長・浜田道昭さんが共著者となっている論文『Umibato: estimation of time-varying microbial interaction using continuous-time regression hidden Markov model』が国際学会ISMB/ECCB2021の口頭発表に採択されました。 [HERE] 2021/04/09 生命機能解析班・玉野孝一さん、CBBD-OIL副ラボ長・油谷幸代さん両名が責任著者となっている論文『Improvement of free fatty acid secretory productivity in Aspergillus oryzae by comprehensive analysis on time-series gene expression』が『Frontiers in Microbiology』に掲載されました。 [HERE] 2021/04/06 配列解析アルゴリズム班・齋藤裕さんが共著者となっている論文『Rational thermostabilisation of four-helix bundle dimeric de novo proteins』が『Scientific Reports』に掲載されました。 [HERE] 2021/03/29 生命機能解析班・露崎隼さんらの論文『Wake-up alarm: virtual time-lapse gene expression landscape illuminates mechanisms underlying dormancy breaking of germinating spores』が『Current Genetics』に掲載されました。 [HERE] 2021/03/24 配列解析アルゴリズム班班長・浜田道昭さんが共著者となっている論文『Possible roles for the hominoid-specific DSCR4 gene in human cells』が『Genes & Genetic Systems』に掲載されました。 [HERE] 2021/03/24 配列解析アルゴリズム班・井内仁志さん、同班長・浜田道昭さんの論文『Jonckheere–Terpstra–Kendall-based non-parametric analysis of temporal differential gene expression』が『NAR Genomics and Bioinformatics』に掲載されました。 [HERE] 2021/03/01 元配列解析アルゴリズム班・Yiqian Zhangさん、同班長・浜田道昭さん両名が責任著者となっている論文『Identification of m6A-associated RNA binding proteins using an integrative computational framework』が『Frontiers in Genetics』に掲載されました。 [HERE] 2021/02/25 配列解析アルゴリズム班・齋藤裕さんが共著者となっている論文『Adipose-derived mesenchymal stem cells differentiate into heterogeneous cancer-associated fibroblasts in a stroma-rich xenograft model』が『Scientific Reports』に掲載されました。 [HERE] 2021/02/22 生命機能解析班・宮崎亮さんが責任著者となっている論文『Frischella japonica sp. nov., an anaerobic member of the Orbales in the Gammaproteobacteria, isolated from the gut of the eastern honey bee, Apis cerana japonica Fabricius』が『International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology』に掲載されました。 [HERE] 2021/01/20 配列解析アルゴリズム班・曽超さん、小野口真広さん、同班長・浜田道昭さんの論文『Association analysis of repetitive elements and R-loop formation across species』が『Mobile DNA』に掲載されました。 [HERE] 2021/01/01 配列解析アルゴリズム班・齋藤裕さんの解説『ゲノムは遺伝子を単語とする文章である（か？）』が『バイオサイエンスとインダストリー』に掲載されました。 [HERE] 2020/12/28 配列解析アルゴリズム班・曽超さん、小野口真広さん、同班長・浜田道昭さんのプレプリント『Association analysis of repetitive elements and R-loop formation across species』がpreLightsで紹介されました。 [HERE] 2020/12/17 配列解析アルゴリズム班・曽超さん、同班長・浜田道昭さんの論文『Detection and characterization of ribosome-associated long noncoding RNAs』が『Methods in Molecular Biology』に掲載されました。 [HERE] 2020/12/12 元生命機能解析班・菅野彩佳さん、元生命機能解析班・山﨑美輝さん、生命機能解析班・富永大介さん、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんらの論文『Cortical transcriptome analysis after spinal cord injury reveals the regenerative mechanism of central nervous system in CRMP2 knock-in mice』が『Neural Regeneration Research』に掲載されました。 [HERE] 2020/12/03 生命機能解析班・安武義晃さん、CBBD-OIL副ラボ長・油谷幸代さん、元CBBD-OILラボ付・田村具博さんらの論文『Bacterial triacylglycerol lipase is a potential cholesterol esterase: Identification of a key determinant for sterol-binding specificity』が『International Journal of Biological Macromolecules』に掲載されました。 [HERE] 2020/11/19 生命機能解析班・露崎隼さん、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんらの論文『シングルセルRNA-seq解析から明らかになった分裂酵母の目覚め機構』が『バイオサイエンスとインダストリー』に掲載されました。 [HERE] 2020/11/11 配列解析アルゴリズム班・齋藤裕さんが共著者となっている論文『Predicting antibody affinity changes upon mutations by combining multiple predictors』が『Scientific Reports』に掲載されました。 [HERE] 2020/10/05 配列解析アルゴリズム班・齋藤裕さんの総説『機械学習による生体分子の機能改良』が『JSBi Bioinformatics Review』に掲載されました。 [HERE] 2020/09/25 配列解析アルゴリズム班班長・浜田道昭さんが責任著者となっている論文『PBSIM2: a simulator for long read sequencers with a novel generative model of quality scores』が『Bioinformatics』に掲載されました。 [HERE] 2020/09/25 配列解析アルゴリズム班・松谷太郎さん、同班長・浜田道昭さんの論文『Parallelized latent Dirichlet allocation provides a novel interpretability of mutation signatures in cancer genomes』が『Genes』に掲載されました。 [HERE] 2020/09/24 配列解析アルゴリズム班・齋藤裕さんが共著者となっている論文『Existence and possible roles of independent non-CpG methylation in the mammalian brain』が『DNA Research』に掲載されました。 [HERE] 2020/09/10 配列解析アルゴリズム班・齋藤裕さんらの論文『放線菌におけるタンパク質生産量向上のための新規コドン最適化技術』が『バイオサイエンスとインダストリー』に掲載されました。 [HERE] 2020/08/31 元生命機能解析班・稲垣拓哉さん、元システムズバイオロジー班・森一樹さん、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんらの論文『Characterization of a novel alphaherpesvirus isolated from the fruit bat Pteropus lylei in Vietnam』が『Journal of Virology』に掲載されました。 [HERE] 2020/08/23 生命機能解析班班長・安佛尚志さんらが一章の執筆を担当した書籍『Cellular Dialogues in the Holobiont』が出版されました。 [HERE] 2020/08/14 生命機能解析班・玉野孝一さん、元CBBD-OILラボ付・田村具博さんらの論文『Enhancement of the productivity of free dihomo-γ-linolenic acid via co-overexpression of elongase and two desaturase genes in Aspergillus oryzae』が『Journal of Bioscience and Bioengineering』にオンライン掲載されました。 [HERE] 2020/07/24 配列解析アルゴリズム班・齋藤裕さんが共著者となっている論文『CodonAdjust: a software for in silico design of a mutagenesis library with specific amino acid profiles』が『Protein Engineering, Design and Selection』に掲載されました。 [HERE] 2020/07/21 生命機能解析班・古藤日子さん、宮崎亮さんが共著者となっている論文『Local necrotic cells trigger systemic immune activation via gut microbiome dysbiosis in Drosophila』が『Cell reports』に掲載されました。 [HERE] 2020/07/18 配列解析アルゴリズム班・曽超さん、同班長・浜田道昭さんの論文『RNA-Seq analysis reveals localization-associated alternative splicing across 13 cell lines』が『Genes』に掲載されました。 [HERE] 2020/07/15 生命機能解析班・玉野孝一さんが共著者となっている論文『Ustiloxin biosynthetic machinery is not compatible between Aspergillus flavus and Ustilaginoidea virens』が『Fungal Genetics and Biology』にオンライン掲載されました。 [HERE] 2020/06/30 『メンバー紹介』 『研究テーマと計画』 ページを更新しました。 2020/06/24 配列解析アルゴリズム班・細田至温さん、元生命機能解析班・西嶋傑さん、配列解析アルゴリズム班班長・浜田道昭さんらの研究成果『酪酸産生機能を有する新細菌群（C細菌群）をヒト腸内フローラから発見』が早稲田大学WEBサイトで紹介されました。 [HERE] 2020/06/24 配列解析アルゴリズム班・細田至温さん、元生命機能解析班・西嶋傑さん、配列解析アルゴリズム班班長・浜田道昭さんらの論文『Revealing the microbial assemblage structure in the human gut microbiome using latent Dirichlet allocation』が『Microbiome』に掲載されました。 [HERE] 2020/06/15 配列解析アルゴリズム班班長・浜田道昭さんらの研究成果『RNAアプタマー創製期間の短縮に有効な新手法RaptRankerを開発』が早稲田大学WEBサイトで紹介されました。 [HERE] 2020/06/15 配列解析アルゴリズム班班長・浜田道昭さんが責任著者となっている論文『RaptRanker: in silico RNA aptamer selection from HT-SELEX experiment based on local sequence and structure information』が『Nucleic Acids Research』に掲載されました。 [HERE] 2020/06/11 生命機能解析班・宮崎亮さんがco-senior authorとなっている論文『Vast differences in strain-level diversity in the gut microbiota of two closely related honey bee species』が『Current Biology』に掲載されました。 [HERE] 2020/06/01 元生命機能解析班・木口悠也さんが一節の執筆を担当した書籍『ヒトマイクロバイオーム Vol.2　～解析技術の進展とデータ駆動型・ターゲット機能型研究最前線～』が出版されました。 [HERE] 2020/05/07 元配列解析アルゴリズム班・岩田大輝さんらの論文『Intel SGXを用いた個人ゲノム情報解析システム』が『2020年暗号と情報セキュリティシンポジウム』におけるSCIS論文賞を受賞しました。 [HERE] 2020/04/21 生命機能解析班・古藤日子さん、宮崎亮さんらの論文『Deep sequencing uncovers caste-associated diversity of symbionts in the social ant Camponotus japonicus』が『mBio』に掲載されました。 [HERE] 2020/03/23 生命機能解析班・菊池義智さんらの論文『Burkholderia insecticola triggers midgut closure in the bean bug Riptortus pedestris to prevent secondary bacterial infections of midgut crypts』が『The ISME Journal』に掲載されました。 [HERE] 2020/03/23 微生物データ解析班・梅村舞子さんらの論文『Promoter tools for further development of Aspergillus oryzae as a platform for fungal secondary metabolite production』が『Fungal Biology and Biotechnology』に掲載されました。 [HERE] 2020/03/14 配列解析アルゴリズム班・Yiqian Zhangさん、同班長・浜田道昭さんの論文『MoAIMS: efficient software for detection of enriched regions of MeRIP-Seq』が『BMC Bioinformatics』に掲載されました。 [HERE] 2020/03/13 生命機能解析班・露崎隼さんらの研究成果『細胞の目覚め関連遺伝子を発見　がん細胞増殖抑制創薬に期待 早稲田大学理工学術院』が医薬通信社WEBサイトに掲載されました。 [HERE] 2020/03/11 生命機能解析班・露崎隼さんらの研究成果『早稲田大、細胞の目覚め解明に繋がる遺伝子発見』が日経バイオテクONLINEに掲載されました。 [HERE] 2020/03/09 生命機能解析班・露崎隼さんらの研究成果『早大、分裂酵母細胞が休眠から目覚める際の遺伝子の発現状態の変化について解明』が日本経済新聞電子版に掲載されました。 [HERE] 2020/03/09 生命機能解析班・露崎隼さんらの研究成果『細胞の目覚め解明に繋がる遺伝子発見』が早稲田大学WEBサイトで紹介されました。 [HERE] 2020/03/09 生命機能解析班・露崎隼さんが筆頭著者、元システムズバイオロジー班・有川浩司さん、CBBD-OILラボ長・竹山春子さんが共著者となっている論文『Time-lapse single-cell transcriptomics reveals modulation of histone H3 for dormancy breaking in fission yeast』が『Nature Communications』に掲載されました。 [HERE] 2020/02/28 微生物データ解析班・安武義晃さん、CBBD-OILラボ付・田村具博さんが共著者となっている論文『Electrochemically boosted cytochrome P450 reaction that efficiently produces 25-hydroxyvitamin D3』が『Journal of Catalysis』に公開されました。 [HERE] 2020/02/24 微生物データ解析班・安武義晃さん、CBBD-OILラボ付・田村具博さんが共著者となっている論文『Nrp1 is activated by konjac ceramide binding-induced structural rigidification of the a1a2 domain』が『Cells』に掲載されました。 [HERE] 2020/02/20 微生物データ解析班・安武義晃さんらの論文『Structural features in common of HBV and HIV-1 resistance against chirally-distinct nucleoside analogues entecavir and lamivudine』が『Scientific Reports』に掲載されました。 [HERE] 2020/02/11 配列解析アルゴリズム班班長・浜田道昭さんらの研究成果『ゲノムDNA転写制御機能を解明』が早稲田大学WEBサイトで紹介されました。 [HERE] 2020/02/11 配列解析アルゴリズム班班長・浜田道昭さんが共著者となっている論文『Nucleosome destabilization by nuclear non-coding RNAs』が『Communications Biology』に掲載されました。 [HERE] 2020/02/06 生命機能解析班・佐々木裕之さんらの論文『Effect of dose and timing of Burdock (Arctium lappa) root intake on intestinal microbiota of mice』が『Microorganisms』に掲載されました。 [HERE] 2019/12/27 生命機能解析班・佐々木裕之さんらの論文『The timing effects of soy protein intake on mice gut microbiota』が『Nutrients』に掲載されました。 [HERE] 2019/12/19 配列解析アルゴリズム班・齋藤裕さんが共著者となっている論文『Comprehensive epigenome characterization reveals diverse transcriptional regulation across human vascular endothelial cells』が『Epigenetics & Chromatin』に掲載されました。 [HERE] 2019/11/16 生命機能解析班・佐々木裕之さんらの論文『Mice microbiota composition changes by inulin feeding with a long fasting period under a two-meals-per-day schedule』が『Nutrients』に掲載されました。 [HERE] 2019/10/24 『論文』 ページを新設しました。 2019/09/06 システムズバイオロジー班・石谷孔司さんらの論文『MitoIMP: A computational framework for imputation of missing data in low-coverage human mitochondrial genome』が『Bioinformatics and Biology Insights』に掲載されました。 [HERE] 2019/09/03 元システムズバイオロジー班・森一樹さん、CBBD-OIL副ラボ長・油谷幸代さんが共著者となっている論文『Cellulase productivity of Trichoderma reesei mutants developed in Japan varies with varying pH conditions』が『Journal of Bioscience and Bioengineering』に掲載されました。 [HERE] 2019/08/27 元生命機能解析班・西嶋傑さんが共著者となっている論文『Long-read metagenomic exploration of extrachromosomal mobile genetic elements in the human gut』が『Microbiome』に掲載されました。 [HERE] 2019/07/22 配列解析アルゴリズム班・マーティン・フリスさんが共著者となっている論文『Long-read sequencing identifies GGC repeat expansions in NOTCH2NLC associated with neuronal intranuclear inclusion disease』が『Nature Genetics』に掲載されました。 [HERE] 2019/07/08 生命機能解析班・宮崎亮さんが責任著者となっている論文『Community analysis of gut microbiota in hornets, the largest eusocial wasps, Vespa mandarinia and V. simillima.』が『Scientific Reports』に掲載されました。 [HERE] 2018/06/20 配列解析アルゴリズム班班長・浜田道昭さんが責任著者となっている論文『Computational approaches for alternative and transient secondary structures of ribonucleic acids』が『Briefings in Functional Genomics』に掲載されました。 [HERE] 2019/06/19 元システムズバイオロジー班・Arturo Magana-Moraさん、微生物データ解析班・安武義晃さん、CBBD-OIL副ラボ長・油谷幸代さんが共著者、CBBD-OILラボ付き・田村具博さんが責任著者となっている論文『Production of recombinant extracellular cholesterol esterase using consistently active promoters in Burkholderia stabilis』が『Biosci Biotechnol Biochem』に掲載されました。 [HERE] 2019/06/10 配列解析アルゴリズム班・岩田大輝さん、清水佳奈さんの論文『属性ベース暗号とIntel SGXを用いた堅牢かつ柔軟なアクセス制御を実現するデータ分析プラットフォームの構築』が『研究報告数理モデル化と問題解決（MPS）』に掲載されました。 [HERE] 2019/06/06 配列解析アルゴリズム班・齋藤裕さんらの論文『Developing a codon optimization method for improved expression of recombinant proteins in actinobacteria』が『Scientific Reports』に掲載されました。 [HERE] 2019/06/06 生命機能解析班・菊池義智さんが共著者となっている論文『Burkholderia gut symbionts associated with European and Japanese populations of the dock bug Coreus marginatus (Coreoidea: Coreidae)』が『Microbes and Environments』に掲載されました。 [HERE] 2019/05/31 生命機能解析班・森山実さんが共著者となっている論文『Morphogenesis and development of midgut symbiotic organ of the stinkbug Plautia stali (Hemiptera: Pentatomidae)』が『Zoological Letters』に掲載されました。 [HERE] 2019/05/28 配列解析アルゴリズム班班長・浜田道昭さんが責任著者となっている論文『a web server for lncRNA-RNA interaction prediction integrated with tissue-specific expression and subcellular localization data』が『Frontiers in Genetics』に掲載されました。 [HERE] 2019/05/18 配列解析アルゴリズム班班長・浜田道昭教授（早稲田大学）らの論文『LncRRIsearch: A Web Server for lncRNA-RNA Interaction Prediction Integrated With Tissue-Specific Expression and Subcellular Localization Data』が『Frontiers in Genetics』に掲載されました。 [HERE] 2019/04/22 システムズバイオロジー班TS・森一樹さんらの論文『A comprehensive reference transcriptome resource for the Iberian ribbed newt Pleurodeles waltl, an emerging model for developmental and regeneration biology』が『DNA RESEARCH』（OXFORD UNIV PRESS 社）に掲載されました。 [HERE] 2019/04/16 配列解析アルゴリズム班・浜田道昭班長（早稲田大学教授）、松谷太郎さん（RA）らの論文『Discovering novel mutation signatures by latent Dirichlet allocation with variational Bayes inference』が『Bioinformatics』に掲載されました。 [HERE] 2019/03/05 ベルサール汐留で開催された早稲田オープン・イノベーション・フォーラム 2019に出展しました。 [HERE] 2019/02/25 沖縄科学技術大学院大学にて5th Core-to-Core International Symposium 『3D Lab-Exchange Program』を開催しました（共催：早稲田大学（TWIns）,早稲田バイオサイエンスシンガポール研究所（WABIOS）,沖縄科学技術大学院大学（OIST）,ボン大学（LIMES）,イタリア技術研究所（IIT）,産総研・早大生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ（CBBD-OIL）,早稲田大学研究ブランディング事業）。 [HERE] 2018/10/25 シンガポールのポリテクニック高等技術専門学校にて2018 Core-to-Core Symposium『Biotechnology Toward Next Generation single cell Analysis』を開催しました。（共催：早稲田バイオサイエンスシンガポール研究所、シンガポールポリテクニック高等技術専門学校、早稲田大学） 2018/10/01 生命機能解析班班長・安佛尚志さんの『ゾウムシの硬さを支える極小ゲノムの共生細菌』が月刊誌『昆虫と自然』第53巻第11号: 19-22頁（ニュー・サイエンス社）に掲載されました。 2018/09/01 アルゴリズム班班長・浜田道昭教授（早稲田大学）らの論文『A Novel Method for Assessing the Statistical Significance of RNA-RNA Interactions Between Two Long RNAs』がウェブサイト『JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY』第25巻第9号: 976-986頁に掲載されました。 [HERE] 2018/09/01 ラボ付研究者・田村具博さん（産業技術総合研究所・生物プロセス研究部門長）らの論文『Complete genome sequence of an efficient vitamin D3-hydroxylating bacterium, Pseudonocardia autotrophica NBRC 12743』がオンライン・ジャーナル『Microbiology Resource Announcements』第7巻第12号: e01105-18頁（American Society for Microbiology社）に掲載されました。 [HERE] 2018/03/06 ドイツ・ボン大学にて4th Core-to-Core International Symposium『3D Lab Exchange Program: Interaction of Nano-Biotechnology, Chemical and Medical Biology and Robotics』を開催しました（共催：ボン大学 (LIMES), 日本学術振興会研究拠点形成事業）。 2017/10/08 生命機能解析班PDの西嶋 傑さんが生命情報科学若手の会　第9回研究会でマイクロソフト賞を受賞しました。 2017/10/08 配列解析アルゴリズム班RAの細田 至温君が生命情報科学若手の会　第9回研究会で 若手奨励賞を受賞しました。 2017/09/29 配列解析アルゴリズム班RAの千島 崇史君と浜田班長が第6回生命医薬情報学連合大会(IIBMP 2017)で研究奨励賞を受賞しました。 2017/09/29 配列解析アルゴリズム班TSのChao Zengさんと浜田班長が第6回生命医薬情報学連合大会(IIBMP 2017)で研究奨励賞を受賞しました。 2017/07/31 8月23日-24日に産総研北海道センター　で「生物プロセス研究部門とCBBD-OILの研究交流セミナー」を開催します。 2017/04/04 第69回生物工学会大会でシンポジウム　「生命システムビッグデータと情報解析技術の融合による生物工学の新展開」を共催します。 2017/04/04 3月13日に開催した成果報告会 報告書をアップしました 2017/03/29 KAUST-AIST-WASEDA Joint WorkShop 報告書をアップしました 2017/03/22 本OILについてYAHOOニュースで紹介されました がんと遺伝子・腸内細菌と疾患などの関連を解析 生物ビッグデータ活用基盤の構築へ （エコノミックニュース） --> 共催ワークショップ・シンポジウムのお知らせ 2018/10/25 シンガポールのポリテクニック高等技術専門学校にて2018 Core-to-Core Symposium『Biotechnology Toward Next Generation single cell Analysis』を開催（共催：早稲田バイオサイエンスシンガポール研究所、シンガポールポリテクニック高等技術専門学校、早稲田大学） 2018/03/06 ドイツ・ボン大学にて4th Core-to-Core International Symposium『3D Lab Exchange Program: Interaction of Nano-Biotechnology, Chemical and Medical Biology and Robotics』を開催（共催：ボン大学 (LIMES), 日本学術振興会研究拠点形成事業） --> 生命システムビッグデータと情報解析技術の融合による生物工学の新展開（第69回生物工学会大会） KAUST-AIST-WASEDA Joint Workshop --> ニュース一覧 2016/07/29 早稲田大学西早稲田キャンパスに「産総研・早大 生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ」（CBBD-OIL）を設立 2016/07/29 早稲田大学西早稲田キャンパスに「産総研・早大 生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ」（CBBD-OIL）を設立 2017/03/13 2017年3月13日　日本橋コレドにおいて成果報告会を開催しました。 2017/03/01 2017年3月1日-3日、KAUSTとのJoint Workshopを開催しました。 2017/03/13 CBBD フォーラムの体制を修正しました。 --> --> 技術の産業界へ：CBBD-OILフォーラム CBBD-OILでは、関係する製薬・食品・健康産業の現場で必要としているニーズを抽出しながら、それを実現するための情報解析技術の開発とデータ解析を行っています。 生命系で測定される各種オーミクスデータをはじめ、臨床データ、各種生活情報等の異なった形式のデータを統合的に解析することで得られる新規知見の産業界への橋渡しを目的としています。 一言で生命情報解析（バイオインフォマティクス）といっても、配列解析から発現解析、システム生物学的アプローチ等、課題によって最適の技術は異なります。 本ラボでは、各社が興味を抱いている技術や研究等のご相談を受けたのち、必要に応じてNDAを締結いたします。 そのうえで、実際に企業が必要とするデータ解析や技術指導、技術コンサルティングを明確にしたのち、その分野の専門家による技術指導・サポートをオンデマンドで実施します。 CBBD-OILについて フォーラムについて メンバー紹介 研究テーマと計画 論文 連絡先 COPYRIGHT © CBBD-OIL All Rights Reserved.